Озеро Большие Швакшты относится к бассейну реки Страча. Местность вокруг водоема преимущественно равнинная (с северо-восточной стороны холмистая), большей частью заросшая лесом, болотистая. Озеро эвтрофного типа, богатое питательными веществами и планктоном. Окружено узкой заболоченной поймой, окаймленной невысоким (до 0,4 м) валунно-галечным валом. Берега низкие, поросшие кустарником и редколесьем. Мелководье обширное, вдоль берегов песчаное, дальше илистое. Наибольшая глубина зафиксирована в центральной части озера. Наблюдается сильное зарастание водоема. На северо-западе соединено широкой протокой с озером Малые Швакшты. В озеро впадают шесть ручьев.
Типичные представители ихтиофауны озера: лещ, щука, угорь (лов в настоящее время запрещен), налим, сом, карпа, сазан, окунь, плотва, красноперка, линь, карась, густера, уклейка. Ранее зарыблялось белым амуром и толстолобиком.
